طراحی و ساخت سازه ژنی کدکننده فاکتوررشد فیبروبلاستی-۲ متصل به بخش ایمونودامیننت توکسین سودوموناس آئروژینوزا

چکیده زمینه و هدف: توقف رگ زایی تومور، رشد سلول های توموری را به طور قابل ملاحظه ای کاهش می دهد. در این میان پروتئین فاکتور رشد فیبروبلاست- 2 (bfgf) به عنوان یک فاکتور رگ زایی مهم هدف مناسبی در مهار رگ زایی تومور و درمان سرطان است. هدف این مطالعه طراحی، ارزیابی و ساخت سازه ژنی نوترکیب در جهت بیان کارامد فیوژن پروتئینی است که دارای بخش های ایمونودامیننت توکسین سودوموناس همراه با bfgf است. روش بررسی: چگونگی حضور لینکرهای مختلف، بهینه سازی کدون های کد کننده اسیدهای آمینه و افزودن توالی سیگنال جهت افزایش ایمونوژنیسیته فیوژن پروتئین از جمله فاکتورهای مهم بوده که در این طراحی لحاظ گردیده است. پس از حصول اطمینان ازکارآمد بودن قطعه طراحی شده، قطعه نوکلئوتیدی کدکننده برای سنتز در وکتور کلونینگ puc57 سفارش داده شد. سپس قطعه ژنی در سایت کلونینگ وکتور بیانی pet28-a قرار گرفت. با استفاده از آزمون های تکثیر ژنی و هضم آنزیمی وجود قطعه طراحی شده در وکتور بیانی مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: بهینه سازی کدون های کد کننده سازه ژنی منجر به افزایش سازگاری کدون های خوانش از 69/0 به 83/0 شد. همچنین میزان محتوی gc (gc content)پس از بهینه سازی از61 به 77/54 کاهش یافت. حضور باند 1214 جفت بازی به روش تکثیرژنی و باند 1029 جفت بازی به روش هضم آنزیمی در الگوی الکتروفورز تأییدکننده فرایند صحیح کلونینگ می باشد. نتیجه گیری: براساس مطالعات صورت پذیرفته، این نخستین مطالعه در خصوص طراحی، ارزیابی و ساخت قطعه کد کننده مربوط به فیوژن پروتئینی است که واجد قطعات مربوط به دومین های ایمونودامیننت فاکتور رشد فیبروبلاست-2 و بخش ایمونودامیننت توکسین سودو است. واژه های کلیدی: رگ زایی تومور، بخش ایمونودامیننت توکسین سودوموناس ائروژینوزا، فاکتور رشد فیبروبلاست 2، نرم افزار dna2